El Instituto de Educación Secundaria Diego de Siloé comenzó a prestar servicios en el curso 1987/1988.

Se localiza en el suroeste de la ciudad de Burgos, en el barrio de San Pedro y San Felices. Concretamente, queda delimitado por las carreteras de salida hacia Madrid y hacia Arcos de la Llana.

El barrio ha sufrido una profunda transformación urbanística gracias a los terrenos liberados por el desvío del ferrocarril, lo que ha favorecido la construcción de viviendas con el consiguiente aumento demográfico y renovación de su población.El centro se encuentra inmerso en un proceso de ampliación de sus instalaciones, que tiene previsto prolongarse en el tiempo unos 25 meses, y que limita en gran medida la actual utilización de los espacios deportivos, y condiciona los accesos al centro de alumnado y personal docente,
En las proximidades del instituto existe un Polideportivo Municipal, un frontón cubierto y campos de deporte, que están también en vías de sufrir una renovación. En la plaza de San Agustín se encuentra el centro de Salud (que atiende a la zona sur de la ciudad), y un centro cívico que sirve para dinamizar las actividades deportivas y culturales del barrio.
El centro tiene alumnos adscritos de tres CEIPS: Padre Manjón, Sierra de Atapuerca y Villagonzalo Pedernales (población rural situada a 6 kilómetros del instituto), lo que condiciona que algunos de nuestros alumnos tengan que utilizar el transporte escolar a diario